Denaturering

Kurs: Basvetenskap 2

Vad är det?

Denaturering innebär att ett protein förlorar sin veckade struktur och därmed sin funktion, till följd av förändrad fysikalisk eller kemisk miljö – framför allt förändringar i temperatur eller pH.

Detaljer

• Förändringar i pH påverkar sura och basiska aminosyrors förmåga att vara protonerade eller deprotonerade, vilket ändrar deras laddning och därmed förmågan att bilda jonbindningar med andra delar av proteinet.
• Förändrat pH påverkar också proteinets interaktion med lösningsmedlet: polära grupper vill vara i polärt lösningsmedel, opolära i opolärt – vid protonering/deprotonering kan grupper byta polaritet och proteinet veckar om sig (opolära delar vandrar inåt, bort från en polär omgivning).
• Exempel: vid lågt pH protoneras sura aminosyrarester (blir “nöjda” och behöver inte längre släppa H+), blir opolära och viker sig inåt bort från den polära miljön → förändrad tertiärstruktur.
• Temperaturökning stör svaga bindningar (vätebindningar, hydrofoba interaktioner) som håller ihop tertiär-/kvartärstruktur.

Klinisk pärla

Enzymer i lysosomer är anpassade till lågt pH (~5) – de fungerar optimalt i sin sura miljö men skulle delvis denatureras i cytoplasmans neutrala pH, vilket skyddar cellen om lysosominnehåll läcker ut.

Kopplingar

Relaterat: Modul 4 - Biokemi Kolhydrater, Enzym, Aminosyra