16s rRNA

Kurs: Basvetenskap 6

Vad är det?

16s rRNA är en komponent av bakteriens ribosomala 30S-subenhet, vars gen ofta används för artidentifiering av bakterier.

Varför är det viktigt / Mekanism

Genen innehåller både starkt konserverade regioner (gemensamma för alla bakterier) och variabla regioner (artspecifika), vilket gör den idealisk för PCR-baserad sekvensering och fylogenetisk klassificering.

Klinisk relevans & Diagnostik

16s rRNA-sekvensering används kliniskt för att identifiera svårodlade eller ovanliga bakterier vid t.ex. odlingsnegativ endokardit.

Klinisk pärla

16s rRNA-sekvensering är särskilt värdefull vid infektioner där konventionell odling misslyckas, t.ex. efter påbörjad antibiotikabehandling.

Kopplingar

Relaterat: Bakterier, Modul 1 - Allmän mikrobiologi