Reassortment

Kurs: Basvetenskap 6

Vad är det?

• Utbyte av hela genomsegment mellan två virus som samtidigt infekterar samma cell. Endast möjligt för virus med segmenterat genom.

Varför är det viktigt / Mekanism

• Segmenterade virus av klinisk betydelse: Influensavirus (8 segment), Rotavirus (11 dubbelsträngade RNA-segment), Bunyavirus (3 segment), Reovirus.
• Vid samtidig infektion packas segmenten in i nya viruspartiklar mer eller mindre slumpmässigt → avkomman kan få en helt ny kombination av gener på en enda replikationscykel.
• Detta är en form av genetiskt hopp, till skillnad från den gradvisa driften som kräver många generationer.

Klinisk relevans & Diagnostik

• Reassortment är mekanismen bakom Antigent skifte och därmed bakom influensapandemier.
• Vid Rotavirus gör reassortment att nya G/P-genotypkombinationer uppkommer – något som följs noga för att bevaka vaccineffekten.
• Reassortment utnyttjas också avsiktligt i vaccinproduktion: influensavaccinstammar tillverkas som reassortanter där HA/NA från den aktuella stammen kombineras med en välväxande laboratoriestam (PR8).

Klinisk pärla

Skilj tre mekanismer för genetisk variation hos virus: mutation (alla virus, gradvis), reassortment (bara segmenterade genom, hela segment byts), rekombination (bara vissa virus, t.ex. Coronavirus och Poliovirus, byte inom ett segment via template switching).

Tenta-fokus

Förutsättningen är alltid samtidig infektion av samma cell med två olika stammar. Utan koinfektion, ingen reassortment. Det är därför blandningskärl (gris, marknader med levande fjäderfä, hushåll med tät djurkontakt) är epidemiologiskt centrala.

Kopplingar

Relaterat: Influensavirus, Antigent skifte, Antigen drift, Rotavirus, Pandemi, Virus