1p19q-kodeletion
Kurs: Basvetenskap 5 Moment 2
Vad är det?
- Samtidig förlust av hela korta armen på kromosom 1 (1p) och hela långa armen på kromosom 19 (19q).
- Uppstår genom en obalanserad translokation t(1;19)(q10;p10) – de två derivatkromosomerna separeras vid mitos och den ena går förlorad. Det är alltså inte två oberoende deletioner utan en enda genetisk händelse.
- Definierande markör för Oligodendrogliom enligt WHO 2021.
Diagnostisk betydelse
- WHO 2021 kräver för diagnosen oligodendrogliom: IDH1- eller IDH2-mutation OCH 1p/19q-kodeletion. Båda krävs – morfologi räcker inte.
- Konsekvensen är att den gamla histologiska kategorin “oligoastrocytom” i praktiken har upphört att existera. Molekylärt hamnar varje sådan tumör antingen i oligodendrogliom (IDH-mut + kodeletion) eller astrocytom (IDH-mut, ATRX-förlust, ingen kodeletion).
- Påvisas med FISH, Mikroarray/SNP-array eller NGS. Viktigt: FISH kan ge falskt positivt vid partiell deletion – kodeletionen ska vara hela armar.
Tenta-fokus
1p/19q-kodeletion och ATRX/TP53-mutation är ömsesidigt uteslutande. Det ger en enkel diagnostisk algoritm för IDH-muterade gliom: ATRX bevarat + kodeletion = oligodendrogliom; ATRX-förlust + TP53-mutation, ingen kodeletion = astrocytom. Två immunhistokemiska färgningar plus ett FISH-test avgör diagnosen. Detta är standardexemplet på hur hjärntumörklassifikationen gick från morfologi till integrerad molekylär diagnos.
Prognostisk och prediktiv betydelse
- Oligodendrogliom med kodeletion har den bästa prognosen av alla diffusa gliom – medianöverlevnad över 15 år vid grad 2, jämfört med ~10 år för IDH-muterat astrocytom och ~1,5 år för Glioblastom.
- Kodeletion är prediktiv för svar på alkylerande kemoterapi, särskilt PCV (prokarbazin, lomustin, vinkristin). RTOG 9402 och EORTC 26951 visade båda att strålning + PCV nästan fördubblade överlevnaden jämfört med enbart strålning – men endast i den kodeleterade gruppen.
Klinisk pärla
1p/19q är ett av de tydligaste exemplen på en markör som är både prognostisk och prediktiv samtidigt. Prognostisk: patienten klarar sig bättre oavsett behandling. Prediktiv: patienten svarar dessutom särskilt bra på just PCV. De två egenskaperna förväxlas ofta – prognostisk säger något om sjukdomen, prediktiv säger något om behandlingsvalet. En markör som bara är prognostisk ändrar inte vad man gör.
Mekanistisk bakgrund
- På 1p ligger CIC (capicua), på 19q ligger FUBP1. Efter armförlusten muteras ofta den kvarvarande allelen – klassisk two-hit-modell för tumörsuppressorer.
- CIC är en transkriptionell repressor nedströms RAS-MAPK-signalering; förlust ger avhämmad MAPK-målgenaktivering.
- Varför kodeleterade tumörer är kemokänsliga är fortfarande inte helt klarlagt – hypoteser rör nedsatt DNA-reparationskapacitet i den hemizygota bakgrunden.
Tenta-fokus
Ordningsföljden i den molekylära diagnostiken av gliom är: först IDH, sedan 1p/19q. IDH-status delar först världen i två (IDH-vildtyp diffusa astrocytära tumörer hos vuxna behandlas som Glioblastom även utan nekros eller mikrovaskulär proliferation, om TERT-promotormutation, EGFR-amplifiering eller +7/−10 finns). Först inom IDH-muterade gruppen är 1p/19q meningsfullt. Att testa 1p/19q på en IDH-vildtypstumör är diagnostiskt meningslöst.
Kopplingar
Relaterat: IDH1, Oligodendrogliom, Glioblastom, Hjärntumör, FISH, Tumörsuppressorgener, MGMT