FISH

FISH och SISH

Vad är det?

FISH (Fluorescent In Situ Hybridization) och SISH (Silver In Situ Hybridization) är två molekylära tekniker som används för att detektera specifika DNA- eller RNA-sekvenser direkt i vävnadsprover.

Mekanism

Båda teknikerna använder markerade DNA-prober som binder specifikt (hybridiserar) till en känd sekvens av intresse i cellernas kromosomer. FISH använder fluorescerande markörer (kräver fluorescensmikroskop), medan SISH använder en silverfärgning (kan ses med vanligt ljusmikroskop). Båda gör det möjligt att räkna exakt antal genkopior eller identifiera en specifik translokation direkt i cellkärnan.

Klinisk relevans & Diagnostik

Används för att bekräfta genamplifiering (t.ex. HER2 efter positiv IHC) och för att identifiera specifika translokationer (t.ex. BCR-ABL1 vid KML, ALK vid lungadenokarcinom, Cyklin D1 vid mantelcellslymfom).

Klinisk pärla

SISH har fördelen att kunna kombineras med vanlig ljusmikroskopi (samma preparat kan användas för både morfologi och genanalys), medan FISH kräver separat fluorescensmikroskopi – en praktisk skillnad mellan de två teknikerna.

Kopplingar

Kurs: Basvetenskap 5 Moment 1

Relaterat: Genamplifiering, Translokation, PCR, BCR-ABL1