Molekylär patologi

Kurs: MDBI

Typ	Diagnostisk disciplin — DNA/RNA/Protein-analys i vävnad
Nyckelmetoder	PCR, sekvensering, FISH, Immunhistokemi
Syfte	Diagnos, prognos och behandlingsstyrning

Vad är det?

• Molekylär patologi kombinerar morfologisk Patologi med analys av DNA, RNA och proteiner för att diagnostisera och karakterisera sjukdom, särskilt Cancer.
• Grunden för Precisionsmedicin — att matcha behandling mot tumörens molekylära profil.

Princip och metoder

• PCR/qPCR: amplifiering och påvisning av specifika sekvenser eller mutationer.
• Nästa generations sekvensering: parallell sekvensering av många gener (paneler).
• FISH: påvisar genfusioner, amplifieringar (t.ex. HER2) och translokationer.
• Immunhistokemi: proteinuttryck som surrogat för molekylär förändring.

Indikation och användning

• Påvisa targeterbara mutationer (EGFR, BRAF, KRAS, ALK).
• Klassificering av Lymfom och Sarkom via specifika translokationer.
• Prediktiva markörer (MSI, PD-L1) och hereditär cancer (BRCA).

Tolkning och fallgropar

• Kräver tillräcklig Tumörcellhalt i provet — låg halt kan ge falskt negativt svar.
• Skilj somatiska (tumör) från konstitutionella (ärftliga) varianter.
• Preanalytik (fixering, Formalin) påverkar DNA-kvaliteten.

Tenta-fokus

Koppla metod till frågeställning: FISH för translokation/amplifiering, NGS för mutationspaneler, Immunhistokemi för proteinuttryck. Molekylär patologi = grunden för Målriktad behandling.

Klinisk pärla

Bedöm alltid Tumörcellhalt innan ett NGS-svar tolkas — ett wild type-svar från ett prov med få tumörceller kan vara falskt negativt.

Kopplingar

• Patologi — moderdisciplinen
• Missense-mutation — typisk förändring som analyseras
• Immunhistokemi — kompletterande proteinmetod
• Multiparametrisk analys — besläktad flerparametrig ansats
• Målriktad behandling — det kliniska syftet