Kopietalsvariation

Kurs: MDBI

Typ	Strukturell genomvariation
Definition	Ändrat antal kopior av ett DNA-segment
Två riktningar	Amplifiering (fler) vs Deletion (färre)

Vad är det?

• Kopietalsvariation (copy number variation, CNV) innebär att ett större DNA-segment finns i ett annat antal kopior än de normala två (en per homolog).
• Kan vara konstitutionell (medfödd, i alla celler) eller somatisk/förvärvad (t.ex. i en Tumör).

Funktion / betydelse

• Förändrar gendos: amplifiering av en Onkogen → ökat uttryck och tillväxtdrivande signal; Deletion som drabbar en Tumörsuppressorgen → förlorad broms (jfr Knudsons hypotes).
• Konstitutionella CNV bidrar till normal Genetisk variation men även till mikroduplikationssyndrom (t.ex. DiGeorge).

Diagnostisk användning

• Klassiska tumör-CNV: HER2-amplifiering (Bröstcancer, Ventrikelcancer) → Trastuzumab; MYCN-amplifiering (Neuroblastom) → sämre prognos; EGFR-amplifiering (Glioblastom).
• Påvisas med FISH (riktat), Array-CGH/SNP-array (genomövergripande) eller NGS.

Klinisk koppling

• Terapistyrande (val av målriktad behandling) och prognostisk markör i modern Molekylärpatologi.
• Vid konstitutionell utredning: Array-CGH är förstahandsmetod vid oklar Utvecklingsstörning/multipla missbildningar.

Tenta-fokus

CNV = ändrad gendos. Amplifiering av onkogen (HER2, MYCN, EGFR) driver cancer och styr behandling; deletion av tumörsuppressor tar bort en broms. Skilj CNV (segment/gennivå) från Aneuploidi (hela kromosomer) och Punktmutation (enstaka baser).

Klinisk pärla

HER2-amplifiering är exemplet att kunna: FISH/IHC avgör om bröstcancern ska ha Trastuzumab. En kopietalsförändring är alltså inte bara biologi utan direkt terapibeslut.

Kopplingar

• HER2 — kliniskt viktigaste amplifieringen
• MYCN — prognostisk amplifiering vid neuroblastom
• Onkogen — aktiveras ofta via amplifiering
• Array-CGH — metod för att kartlägga CNV
• Aneuploidi — angränsande begrepp (hel-kromosomnivå)