Deletion

Kurs: MDBI

Typ	Strukturell kromosom- eller genavvikelse
Definition	Förlust av ett DNA-/kromosomsegment
Undertyper	Interstitiell och terminal deletion
Detektion	Karyotyp, FISH, array

Vad är det?

• En deletion är en förlust av ett DNA-avsnitt — allt från några baspar till ett helt kromosomsegment.
• Kan drabba en enskild gen, en del av en gen eller många gener samtidigt.

Mekanism

• Interstitiell deletion (ett mittsegment försvinner) eller terminal deletion (en kromosomände förloras).
• Leder till haploinsufficiens eller till förlust av en tumörsuppressor (t.ex. TP53), vilket kan driva malign utveckling.

Diagnostisk / Klinisk relevans

• Vanliga och prognostiskt viktiga deletioner vid hematologisk sjukdom:
  • del(5q) — MDS (5q−-syndrom, gynnsam, känslig för Lenalidomid).
  • del(17p) — förlust av TP53, ogynnsam vid KLL och Myelom.
  • del(13q) (isolerad) — gynnsam vid KLL.
  • del(11q) — ATM-förlust, ogynnsam vid KLL.
• Påvisas med karyotyp, FISH eller array.

Tenta-fokus

Deletion = förlust av DNA-/kromosomsegment. Lär de prognostiska exemplen: del(5q) och isolerad del(13q) = gynnsamma; del(17p) (TP53) och del(11q) (ATM) = ogynnsamma.

Klinisk pärla

del(17p) = borttappad TP53 = kemoterapiresistens och dålig prognos — ett återkommande tema i både KLL och Myelom. FISH för 17p ingår därför i utredningen.

Kopplingar

• FISH — påvisar deletioner med lokusspecifika prober.
• TP53 — nyckelgen som förloras vid del(17p).
• Karyotypering — grundmetod för strukturavvikelser.
• Genlokus — deletionen anges relativt kromosomband.
• Brottpunkt — deletionens gränser definieras av brottpunkter.