Genetisk testning

Kurs: MDBI

Typ	Diagnostisk metod — analys av DNA/RNA/kromosomer
Två nivåer	Konstitutionell (germline) vs somatisk
Metoder	PCR, sekvensering (NGS/Sanger), FISH, karyotypering
Nyckelfynd	Styr diagnos, prognos och målriktad terapi

Vad är det?

• Analys av arvsmassan för att påvisa mutationer, kromosomavvikelser eller genrearrangemang.
• Konstitutionell (germline) testning söker medfödda, ärftliga varianter; somatisk testning söker förvärvade förändringar i tumörceller.

Princip / Utförande

• PCR — amplifierar specifika DNA-avsnitt.
• Sekvensering — Sanger (enstaka gen) eller massiv parallellsekvensering (genpaneler, exom, genom).
• FISH/CISH — påvisar specifika genrearrangemang, amplifieringar eller deletioner.
• Karyotypering — översikt av hela kromosomuppsättningen (kräver oftast färska, delande celler).
• Material: blod (germline), färsk/fryst eller formalinfixerad tumörvävnad, cytologiskt cellblock.

Indikation / Användning

• Ärftliga syndrom: t.ex. RET-mutation vid MEN2 → underlag för profylaktisk tyreoidektomi; CDC73 vid HPT-JT-syndrom.
• Tumördiagnostik: klassificera och prognostisera, t.ex. myeloida neoplasier (NPM1, FLT3), lymfom (genrearrangemang av Ig/TCR).
• Målriktad behandling: identifiera behandlingsbara drivermutationer.
• Prediktiv testning av friska anlagsbärare i drabbade släkter.

Tolkning / Fallgropar

• Skilj patogen variant från variant av oklar signifikans (VUS) och benign polymorfism.
• Germline-fynd har konsekvenser för släktingar → kräver genetisk vägledning, samtycke och etisk hänsyn.
• Formalinfixering kan fragmentera DNA → föredra färskt material för känsliga analyser.
• Ett negativt test utesluter inte sjukdom om fel gen/metod använts (analytiska begränsningar).

Tenta-fokus

Kunna skilja germline (ärftlig, tas på blod, berör släkten) från somatisk (tumörförvärvad) testning, och ge exempel: RET vid MEN2 → profylaktisk tyreoidektomi; NPM1/FLT3 vid akut myeloisk leukemi.

Klinisk pärla

Ett germline-svar är ett släktsvar. Positiv anlagstestning kräver genetisk vägledning och berör föräldrar, syskon och barn — därför tas det aldrig lättvindigt utan informerat samtycke.

Kopplingar

• Sekvensering — kärnmetod inom genetisk testning
• Mutationspanel — NGS-baserad analys av flera gener samtidigt
• RET — germline-testning styr profylaktisk kirurgi vid MEN2
• Karyotypering — kromosomal översiktsanalys
• FISH — riktad påvisning av genrearrangemang