Mutationspanel

Kurs: MDBI

Typ	Riktad molekylärgenetisk analys (NGS)
Nyckelfynd	Sekvenserar en fördefinierad uppsättning återkommande muterade gener
Användning	Diagnos, klassificering, prognos, terapival och MRD

Vad är det?

• En mutationspanel är en riktad massiv parallellsekvensering som samtidigt analyserar ett urval gener som ofta är muterade vid en viss sjukdomsgrupp.
• Ger diagnostisk, prognostisk och behandlingsstyrande information i hematopatologin — i dag rutin vid Myeloida neoplasier.
• Ett effektivt mellanting mellan enstaka genanalys och helgenomsekvensering.

Princip och utförande

• DNA (ibland RNA) från blod/benmärg berikas för målgenerna och sekvenseras djupt; variantallelfrekvens (VAF) anger klonstorlek.
• Bioinformatisk analys filtrerar bort polymorfismer och klassar varianter (patogen / osäker / benign).
• Exempel på myeloid panel: FLT3, NPM1, CEBPA, TP53, DNMT3A, IDH1/IDH2, ASXL1, RUNX1, SF3B1.

Indikation och användning

• Diagnos/klassificering enligt WHO och riskgruppering (t.ex. ELN vid AML).
• Terapival: påvisa targeterbara mutationer (t.ex. FLT3-hämmare, IDH1/IDH2-hämmare).
• Underlag för molekylär MRD och för att skilja reaktivt från klonalt.

Tolkning och fallgropar

• Klonal hematopoes (CHIP) ger lågfrekventa mutationer hos friska äldre — inte i sig malignitet.
• Att skilja somatisk från konstitutionell (germline) variant kräver ibland referensvävnad.
• Panelen ser bara sina utvalda gener — en negativ panel utesluter inte annan avvikelse.

Tenta-fokus

Mutationspanel = riktad NGS av utvalda gener; central vid Myeloida neoplasier för diagnos + prognos + terapival. Kunna nyckelgener som FLT3, NPM1, TP53 och begreppet VAF.

Klinisk pärla

En låg-VAF-mutation i t.ex. DNMT3A hos en äldre patient kan vara CHIP, inte leukemi — tolka alltid VAF och kontext innan ett fynd får diagnostisk tyngd.

Kopplingar

• NGS — tekniken bakom panelen
• Myeloida neoplasier — främsta indikationsområdet
• FLT3 — exempel på targeterbar mutation
• MRD — panelen ger molekylär restsjukdomsmarkör
• Karyotypering — komplementär cytogenetisk metod
• TP53 — nyckelgen med prognostisk tyngd