Brottpunkt
Kurs: MDBI
| Typ | Cytogenetiskt begrepp — platsen för ett kromosombrott |
| Betydelse | Sammanfogar gener vid translokationer → fusionsgen |
| Exempel | t(9;22) BCR-ABL1, t(14;18) IGH-BCL2 |
| Detektion | FISH (break-apart / dual-fusion), PCR |
Vad är det?
- En brottpunkt (breakpoint) är den exakta positionen på en kromosom där DNA-strängen bryts vid en strukturell avvikelse — Translokation, Deletion, Inversion eller Insertion.
- Vid en Translokation finns två brottpunkter som förenar segment från olika kromosomer.
Mekanism
- När två brottpunkter sammanfogas kan resultatet bli antingen:
- en Fusionsgen (två gener slås ihop, t.ex. BCR-ABL1 vid t(9;22)), eller
- att en gen hamnar under en stark promotor/enhancer och överuttrycks (t.ex. MYC vid t(8;14) eller CCND1 vid t(11;14)).
- Brottpunkter ligger ofta i specifika, återkommande regioner (t.ex. major breakpoint cluster region vid KML).
Diagnostisk användning
- Break-apart-FISH: två prober flankerar brottpunkten — ett splittrat signalpar avslöjar rearrangemang oavsett fusionspartner.
- Dual-fusion-FISH: prober på båda generna → kolokaliserad fusionssignal.
- PCR över fusionspunkten används för diagnos och MRD-övervakning.
Klinisk relevans
- Brottpunktens läge bestämmer vilken Fusionsgen som bildas och därmed diagnos, prognos och ibland behandlingsmål (t.ex. Imatinib mot BCR-ABL1).
Tenta-fokus
En Translokation har två brottpunkter; deras läge avgör vilken Fusionsgen som bildas. Break-apart-prober flankerar en brottpunkt och visar splittring vid rearrangemang.
Klinisk pärla
Kopplingar
- Translokation — vanligaste avvikelsen som skapar brottpunkter.
- Fusionsgen — produkten av två sammanfogade brottpunkter.
- FISH — huvudmetod för att påvisa brottpunkter.
- DNA-prob — flankerar brottpunkten vid break-apart-analys.
- BCR-ABL1 — klassiskt exempel på brottpunktsdefinierad fusionsgen.
- Genlokus — brottpunkten anges relativt genernas lokus.