Episomalt DNA

Kurs: Basvetenskap 6

Vad är det?

  • DNA som ligger fritt i cellkärnan eller cytoplasman utan att vara integrerat i värdens (eller bakteriens) kromosom, men som ändå replikeras och förs vidare.
  • Två huvudsammanhang:
    • Hos bakterier: plasmider som replikerar självständigt vid sidan av kromosomen.
    • Hos virus: virusgenom som ligger kvar som en cirkulär, fri form i den infekterade cellens kärna, t.ex. herpesvirus under latens och HPV i tidig infektion.

Varför är det viktigt / Mekanism

  • Episomal latens är hur herpesvirus överlever livet ut: virusgenomet ligger cirkulariserat i kärnan hos t.ex. sensoriska ganglieneuroner (HSV, VZV) eller B-celler (EBV), med minimal genuttryck och därmed nästan ingen synlighet för immunförsvaret. Vid immunsuppression eller stress reaktiveras det.
  • Läkemedel som aciklovir verkar bara på replikerande virus. Det episomala latenta genomet är därför helt oåtkomligt för behandling — man kan behandla skoven men aldrig bota infektionen.
  • Hos HPV är skillnaden mellan episomalt och integrerat genom direkt kopplad till cancerrisk: så länge genomet är episomalt hålls onkgenerna E6 och E7 i schack av regulatorgenen E2. Vid integration i värdgenomet bryts ofta E2 sönder, E6/E7 avreglereras, p53 och Rb slås ut — och en höggradig dysplasi kan utvecklas mot cervixcancer.
  • Hos bakterier är plasmidburen (episomal) resistens särskilt farlig eftersom den kan överföras horisontellt mellan celler och till och med mellan arter, via konjugation.

Klinisk relevans & Diagnostik

  • Att herpesvirus aldrig kan elimineras är grunden för att man ger suppressionsbehandling i stället för kurativ behandling vid frekventa recidiv.
  • Att HPV-integration driver cancer är den molekylära grunden för att screening riktas mot persisterande infektion med högrisktyper, inte mot varje enskild positiv HPV-test.

Klinisk pärla

Episomalt = latent, tyst, obehandlingsbart men i regel ofarligt. Integrerat = permanent, och vid HPV det steg som gör infektionen onkogen.

Tenta-fokus

“Varför kan man inte bota herpes?” Svaret är episomal latens i neuronet — inte resistens och inte dålig läkemedelspenetration.

Kopplingar

Relaterat: Plasmider, Latens, Herpesvirus, humant papillomvirus, Horisontell genöverföring, Antibiotikaresistens