Baltimore-klassifikationen

Kurs: Basvetenskap 6

Vad är det?

• Ett system som delar in alla virus i sju grupper utifrån hur deras genom är uppbyggt och hur de tar sig fram till ett mRNA som värdcellens ribosomer kan läsa.
• Utgångspunkten är att allt proteinsyntes i en cell kräver mRNA i positiv polaritet (+). Varje virus måste alltså lösa problemet “hur blir mitt genom till (+)mRNA?”.

Varför är det viktigt / Mekanism

• Grupp I — dsDNA: dubbelsträngat DNA. Transkriberas i regel av värdcellens polymeras i kärnan. Exempel: Herpesvirus, Adenovirus.
• Grupp II — ssDNA: enkelsträngat DNA, måste först göras dubbelsträngat. Exempel: parvovirus (Erythrovirus B19).
• Grupp III — dsRNA: dubbelsträngat RNA. Måste ha med sig ett eget RNA-beroende RNA-polymeras. Exempel: Rotavirus.
• Grupp IV — (+)ssRNA: genomet är redan mRNA och kan översättas direkt av ribosomen. Exempel: Poliovirus, calicivirus, Coronavirus, Hepatit C-virus.
• Grupp V — (-)ssRNA: genomet är komplementet till mRNA och måste först skrivas om — därför måste polymeraset finnas färdigt inne i partikeln. Exempel: Influensavirus, Rabiesvirus, RS-virus.
• Grupp VI — (+)ssRNA-RT (retrovirus): RNA som via omvänt transkriptas skrivs om till DNA och integreras i värdgenomet. Exempel: HIV.
• Grupp VII — dsDNA-RT: DNA som replikeras via ett RNA-mellansteg. Exempel: Hepatit B-virus.

Klinisk relevans & Diagnostik

• Gruppen förutsäger var i cellen viruset replikerar och därmed vilka läkemedelsmål som finns. Grupp VI och VII är de enda som kan angripas med RT-hämmare.
• Grupp V och III måste bära med sig eget polymeras i virionen; deras nakna genom är därför icke-infektiöst om det injiceras ensamt i en cell — ett klassiskt tentafråga-fynd.
• (+)ssRNA-virus (grupp IV) har infektiöst naket genom, eftersom det kan läsas direkt.

Klinisk pärla

Frågan “har viruset med sig ett eget polymeras?” avgörs helt av Baltimore-gruppen: alla utom grupp I, II och IV måste ha det, eftersom värdcellen saknar enzymer som kan kopiera RNA till RNA eller RNA till DNA.

Tenta-fokus

Lär dig (+)ssRNA = genomet är mRNA = infektiöst naket genom kontra (-)ssRNA = måste ha med sig polymeras = icke-infektiöst naket genom. Det är den vanligaste tillämpningen av Baltimore-schemat på tenta.

Kopplingar

Relaterat: Virus, Virion, Omvänt transkriptas, Rotavirus, HIV, Influensavirus