Mikrobiota och normalflora
Kurs: MDBI Del: 02 Mikrobiologi, Immunologi och Transfusionsmedicin
Målsättning
- Kunna redogöra för mikrobiotans roll och för vilka kroppsvätskor som normalt är sterila — en förutsättning för att kunna tolka odlingssvar.
Att kunna normalfloran är förutsättningen för att kunna tolka ett odlingssvar över huvud taget. Samma bakterie kan vara fullständigt harmlös på en lokal och farlig på en annan, och utan att veta vad som normalt hör hemma var går det inte att avgöra om ett fynd är förväntat eller patologiskt. Det här avsnittet går igenom mikrobiotans dubbla roll och, framför allt, vilka kroppsvätskor som normalt är sterila.
Mikrobiotans roll
Mikrobiotan — normalfloran — har en dubbel roll som är värd att hålla i minnet. Å ena sidan utgör den ett skydd mot infektioner genom så kallad koloniseringsresistens, där de “snälla” bakterierna håller undan patogener. Å andra sidan är den en källa till potentiellt patogena mikroorganismer som kan orsaka sjukdom om de hamnar på fel plats. Olika kroppsdelar utgör specifika ekologiska nischer, och förekomsten kan vara resident (fast flora) eller transient, det vill säga ett tillfälligt bärarskap. Sammansättningen påverkas av fysiologiska förhållanden, bakteriell adherens och samspelet mellan bakterier och kroppens antibakteriella peptider.
Normalt sterila kroppsvätskor
Kärnan för tolkningen är att vissa kroppsvätskor normalt är helt sterila. Blod, cerebrospinalvätska, ledvätska och urin (i blåsan) ska inte innehålla några bakterier alls, och ett fynd där är därför oftast patologiskt och tolkas som infektion tills motsatsen visats.
Flora per lokal
För de icke-sterila lokalerna gäller det istället att känna till vad som normalt växer, så att man kan skilja normalflora från äkta patogen.
| Lokal | Normalflora |
|---|---|
| Hud (fuktiga områden) | Koagulasnegativa stafylokocker, Cutibacterium, Corynebacterium |
| Näsa | Staphylococcus aureus (bärarskap) |
| Nasofarynx (barn) | Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Moraxella catarrhalis, Streptococcus pyogenes |
| Munhåla/svalg | Viridansstreptokocker, Neisseria, Anaeroba bakterier |
| Nedre luftvägar / sinus | Normalt sterilt |
| Magsäck/duodenum | Normalt sterilt utom Helicobacter pylori |
| Colon | Anaeroba bakterier (~95 %), gramnegativa (Escherichia coli) |
| Vagina (fertil kvinna) | Laktobaciller, E. coli, jäst, GBS |
Definition
Resident flora = fast etablerad normalflora på en lokal; transient flora/bärarskap = tillfällig kolonisering (t.ex. S. aureus i näsan) som kan bli smittkälla.
Tenta-fokus
Fynd av Koagulasnegativa stafylokocker i en blododling är oftast kontamination från huden — men kan vara äkta vid främmande material (proteser, katetrar). Kunna vilka kroppsvätskor som är normalt sterila (blod, likvor, ledvätska, urin).
Klinisk pärla
Ett odlingssvar kan aldrig tolkas utan att veta lokalens normalflora — samma bakterie kan vara harmlös på en lokal och patogen på en annan (t.ex. E. coli i colon vs i blod eller urin).
Kopplingar
Relaterat: Mikrobiota, Normalflora, Kontamination, Blododling, Koagulasnegativa stafylokocker, Helicobacter pylori