NOD2
Kurs: Basvetenskap 5
Vad är det?
- Nucleotide-binding Oligomerization Domain-containing protein 2 — en intracellulär mönsterigenkännande receptor (PRR) i NLR-familjen.
- Kodas av genen NOD2 (tidigare CARD15) på kromosom 16q12.
- Första genen som säkert kopplades till Crohns sjukdom och därmed ett landmärke inom komplex sjukdomsgenetik.
Struktur och uttryck
- Tre domäner: två N-terminala CARD-domäner (proteininteraktion), en central NACHT/NOD-domän (oligomerisering) och en C-terminal leucinrik repeatregion (LRR) som utgör ligandbindande sensor.
- Uttrycks i cytosolen hos Monocyter, Makrofager, dendritiska celler, Paneth-celler i tunntarmens kryptor och i tarmepitel.
- Paneth-cellernas uttryck är särskilt relevant för terminala ileums sjukdomsbenägenhet vid Crohn.
Funktion och signalering
- Ligand: muramyldipeptid (MDP), en nedbrytningsprodukt av Peptidoglykan som finns i cellväggen hos både grampositiva och gramnegativa bakterier.
- NOD2 känner alltså av bakterier som tagit sig INTRACELLULÄRT — komplementärt till Toll-liknande receptorer som sitter i cellmembran och endosomer.
- Vid MDP-bindning sker konformationsändring och oligomerisering → rekrytering av kinaset RIPK2 via CARD-CARD-interaktion.
- RIPK2 aktiverar IKK-komplexet → nedbrytning av IkB → NF-kB translokerar till kärnan → transkription av proinflammatoriska cytokiner (TNF-alfa, IL-6, IL-8) och antimikrobiella peptider.
- Parallellt aktiveras MAPK-vägen.
- NOD2 driver även autofagi genom att rekrytera ATG16L1 till plasmamembranet vid bakteriellt intrång — kopplingen mellan de två starkaste Crohn-generna.
- NOD2 bidrar till att inducera defensiner (framför allt alfa-defensiner från Paneth-celler) som håller mikrobiotan på avstånd från epitelet.
Klinisk genetik
- Tre vanliga varianter i eller nära LRR-domänen (R702W, G908R och frameshiftmutationen L1007fs) är förlust-av-funktion och associerade med Crohns sjukdom.
- Heterozygoti ger cirka 2–4 gånger ökad risk; homozygoti eller sammansatt heterozygoti 20–40 gånger.
- Genotypen är kopplad till ileal lokalisation, tidig debut, strikturerande fenotyp och ökat behov av kirurgi.
- Varianterna är vanliga i europeiska populationer men i princip frånvarande i östasiatiska — förklarar varför NOD2 inte förklarar Crohn i Japan och Korea.
- Penetransen är låg: de flesta bärare blir aldrig sjuka. NOD2 illustrerar därför tydligt principen om multifaktoriell sjukdom med gen-miljöinteraktion.
Paradoxen förlust av funktion → inflammation
- Att en LOSS-mutation i en proinflammatorisk receptor ger inflammatorisk tarmsjukdom är kontraintuitivt men förklaras av:
- Minskad defensinproduktion i Paneth-celler → nedsatt antibakteriellt skydd i kryptan.
- Nedsatt autofagi → försämrad bakteriell clearance intracellulärt.
- Bakteriell persistens och Dysbios → kompenserande, kroniskt överdriven aktivering av adaptiv immunitet med Th1/Th17-svar.
- Bortfall av NOD2:s tolerogena och NF-kB-dämpande funktion vid upprepad MDP-exponering.
Andra NOD2-associerade sjukdomar
- Blaus syndrom och tidigt debuterande sarkoidos: GAIN-of-function-mutationer i NACHT-domänen ger konstitutiv NF-kB-aktivering med granulomatös artrit, uveit och dermatit — motsatt mekanism jämfört med Crohn.
- Association med graft-versus-host-sjukdom efter Stamcellstransplantation och med susceptibilitet för Lepra.
Klinisk pärla
NOD2-genotypning används INTE i klinisk rutin för att ställa Crohn-diagnos: penetransen är för låg och prediktiva värdet för dåligt. Genen är däremot central för att förstå sjukdomsmekanismen och för forskning om riskstratifiering.
Tenta-fokus
Två saker examineras ofta: att liganden är muramyldipeptid från Peptidoglykan och att signalen går via RIPK2 till NF-kB. Kom ihåg att Crohn-varianterna är LOSS of function medan Blaus syndrom beror på GAIN of function i samma gen.
Kopplingar
- Crohns sjukdom — den starkaste enskilda genetiska riskfaktorn
- NF-kB — den centrala transkriptionsfaktorn nedströms
- Toll-liknande receptorer — membranbundna motsvarigheter i medfödd immunitet
- Paneth-celler — defensinproducerande celler beroende av NOD2
- Peptidoglykan — källan till liganden muramyldipeptid