Faecesodling

Kurs: Basvetenskap 6

Vad är det?

• Mikrobiologisk odling av avföringsprov för att påvisa tarmpatogena bakterier vid Gastroenterit och Diarré.
• I dag ofta kombinerad med eller ersatt av PCR-baserade multiplexpaneler, men odling behövs fortfarande för Resistensbestämning och epidemiologisk typning.

Princip

• Faeces innehåller enorma mängder normalflora (Anaeroba bakterier, Escherichia coli) — patogenerna måste därför selekteras fram.
• Man använder selektiva och differentierande medier som hämmar normalfloran och gör patogenkolonier synligt annorlunda.
• Exempel: SS-agar/XLD/Hektoen (laktos-icke-fermenterare, H₂S-produktion → Salmonella och Shigella), CIN-agar (Yersinia enterocolitica), Skirrows/CCDA vid 42 °C i mikroaerofil miljö (Campylobacter jejuni), Sorbitol-MacConkey för EHEC O157 (sorbitol-negativ).
• Anrikningsbuljong (selenit, Rappaport) ökar utbytet för Salmonella.

Utförande

• Färskt prov i transportmedium (Cary-Blair) — mikroberna överlever dåligt vid uttorkning, särskilt Shigella.
• Ange frågeställning och reseanamnes på remissen. Laboratoriet odlar rutinmässigt bara mot standarduppsättningen; Yersinia enterocolitica, Vibrio cholerae och EHEC kräver ofta särskild begäran.
• Inkubation 18–48 timmar; misstänkta kolonier verifieras biokemiskt, med MALDI-TOF och serotypning.
• Svarstid vanligen 2–4 dygn.

Tolkning

• Fynd av tarmpatogen = kliniskt signifikant, eftersom dessa inte tillhör normalfloran.
• Negativ odling utesluter inte infektion — virus (Norovirus, Rotavirus) och parasiter (Giardia lamblia, Cryptosporidium) påvisas inte med bakterieodling.
• Clostridioides difficile diagnostiseras med toxin/GDH-test eller PCR, inte med rutinodling.
• Parasiter kräver separat prov för Cystor och maskägg eller PCR.
• Positivt fynd av Salmonella, Shigella, Campylobacter jejuni, EHEC eller Vibrio cholerae är anmälningspliktigt enligt Smittskyddslagen med Smittspårning och förhållningsregler.

Fallgropar

• Prov taget efter påbörjad Antibiotikabehandling ger ofta falskt negativt svar.
• Campylobacter jejuni kräver 42 °C och mikroaerofil atmosfär — växer inte på vanlig agar.
• EHEC O157 kan vara sorbitol-positiv i icke-O157-serogrupper; toxingen-PCR (stx1/stx2) krävs för säker diagnos.
• Bärarskap efter genomgången Salmonella kan kvarstå i veckor–månader utan symtom — ett positivt kontrollprov betyder inte nödvändigtvis aktiv sjukdom.
• Odling har låg utbyte vid kronisk diarré utan infektiös orsak — undvik rutinmässig provtagning vid symtom >2 veckor utan riskfaktorer.

När ska prov tas?

• Blodig Diarré, hög Feber eller allmänpåverkan.
• Diarré efter utlandsresa eller misstänkt Livsmedelsburen infektion med gruppinsjuknande.
• Immunsuppression, Inflammatorisk tarmsjukdom eller nyligen antibiotikabehandling.
• Personal i riskyrken (livsmedel, vård, förskola) enligt Smittskyddslagen.

Klinisk pärla

Skriv reseanamnes och specifik frågeställning på remissen. Ett prov från en patient nyss hemkommen från Sydostasien bör analyseras även för Vibrio och parasiter — det görs inte automatiskt.

Tenta-fokus

Vid misstänkt EHEC (blodig diarré hos barn, risk för HUS) ska man inte ge antibiotika i väntan på svar — antibiotika ökar toxinfrisättningen och därmed risken för HUS.

Kopplingar

• Livsmedelsburen infektion — kliniskt sammanhang
• Salmonella, Campylobacter jejuni, Shigella — målpatogener
• Resistensbestämning — därför behövs odling trots PCR
• Smittskyddslagen — anmälningsplikt vid fynd