Molekylärgenetisk analys

Kurs: MDBI Del: 03 Klinisk Kemi Avsnitt: 04 Anemier och Leukemier

Vad är det?

Molekylärgenetisk analys är DNA- eller RNA-baserad undersökning av gener, mutationer och fusionstranskript i tumörceller. Den utgör tillsammans med kromosomanalys och benmärgsmikroskopi grunden för dagens diagnostik och riskgruppering vid leukemi.

Mekanism

• Nukleinsyra extraheras ur benmärgsaspirat eller perifert blod och amplifieras med PCR-baserade metoder eller sekvenseras.
• Till skillnad från cytogenetisk kromosomanalys, som kräver delande celler och ser stora omlagringar, detekterar molekylärgenetiken även punktmutationer och små insertioner/deletioner.
• Metoden har hög känslighet och kan påvisa kvarvarande sjukdom i mycket låga nivåer, vilket används för behandlingsuppföljning.
• Typexempel är påvisande av fusionsgenen BCR-ABL vid KML, som ger ökad tyrosinkinasaktivitet.

Klinisk relevans & Diagnostik

• Ingår bland de analyser som har särskild betydelse för AML-diagnostik, tillsammans med benmärgsmikroskopi, kromosomanalys och anamnes om tidigare cytotoxisk eller immunsuppressiv behandling.
• Genom den snabba utvecklingen av genetisk diagnostik kan hela arvsmassan kartläggas; en genpanel med drygt femtiotalet gener av särskild betydelse för AML analyseras inom vanlig rutindiagnostik.
• De genetiska förändringarna styr behandlingsval och ligger till grund för WHO-klassifikationen samt riskgruppering enligt European Leukemia Net (ELN). Säkra prognostiska faktorer finns dock ännu inte.
• I cytogenetiken vid KML registreras med vilken metod Bcr-Abl-fusionen påvisats samt andel Ph+ celler.

Kopplingar

Relaterat: Kromosomanalys, Cytogenetik, BCR-ABL, Genpanel, AML, Immunfenotypning, Mutation